Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copz1P61924 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz1P61924 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copz1P61924 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz1P61924 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copz1P61924 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copz1P61924 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copz1P61924 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copz1P61924 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz1P61924 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz1P61924 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz1P61924 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copz1P61924 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copz1P61924 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copz1P61924 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copz1P61924 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms