Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSME3P61289 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSME3P61289 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSME3P61289 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSME3P61289 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSME3P61289 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSME3P61289 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSME3P61289 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSME3P61289 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSME3P61289 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSME3P61289 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSME3P61289 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME3P61289 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME3P61289 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME3P61289 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSME3P61289 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME3P61289 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSME3P61289 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSME3P61289 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSME3P61289 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSME3P61289 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME3P61289 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME3P61289 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME3P61289 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSME3P61289 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSME3P61289 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME3P61289 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME3P61289 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSME3P61289 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME3P61289 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME3P61289 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSME3P61289 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME3P61289 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME3P61289 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME3P61289 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME3P61289 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME3P61289 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSME3P61289 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME3P61289 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME3P61289 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME3P61289 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME3P61289 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME3P61289 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSME3P61289 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME3P61289 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME3P61289 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME3P61289 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME3P61289 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME3P61289 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME3P61289 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME3P61289 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME3P61289 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME3P61289 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME3P61289 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms