Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCE1P61221 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCE1P61221 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCE1P61221 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCE1P61221 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCE1P61221 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms