Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2NP61088 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2NP61088 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2NP61088 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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