Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Eif4a1P60843 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Eif4a1P60843 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Eif4a1P60843 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Eif4a1P60843 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif4a1P60843 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif4a1P60843 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif4a1P60843 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif4a1P60843 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif4a1P60843 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Eif4a1P60843 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms