Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3eP60229 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3eP60229 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3eP60229 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3eP60229 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3eP60229 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms