Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB15P59190 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB15P59190 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB15P59190 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB15P59190 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB15P59190 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB15P59190 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB15P59190 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB15P59190 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB15P59190 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB15P59190 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB15P59190 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB15P59190 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB15P59190 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB15P59190 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB15P59190 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB15P59190 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB15P59190 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB15P59190 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB15P59190 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB15P59190 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB15P59190 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB15P59190 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB15P59190 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB15P59190 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB15P59190 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB15P59190 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB15P59190 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB15P59190 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB15P59190 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB15P59190 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB15P59190 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB15P59190 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB15P59190 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB15P59190 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB15P59190 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB15P59190 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB15P59190 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB15P59190 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB15P59190 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB15P59190 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB15P59190 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB15P59190 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB15P59190 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB15P59190 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB15P59190 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB15P59190 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB15P59190 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB15P59190 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB15P59190 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB15P59190 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB15P59190 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB15P59190 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB15P59190 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB15P59190 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB15P59190 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB15P59190 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB15P59190 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB15P59190 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB15P59190 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB15P59190 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB15P59190 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB15P59190 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB15P59190 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB15P59190 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB15P59190 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB15P59190 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB15P59190 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB15P59190 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB15P59190 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB15P59190 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB15P59190 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB15P59190 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms