Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00310P59036 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00310P59036 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00310P59036 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms