Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3BP58499 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms