Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB25P57735 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB25P57735 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB25P57735 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB25P57735 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB25P57735 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB25P57735 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB25P57735 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB25P57735 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB25P57735 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB25P57735 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB25P57735 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB25P57735 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB25P57735 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB25P57735 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB25P57735 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB25P57735 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB25P57735 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB25P57735 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB25P57735 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB25P57735 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB25P57735 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB25P57735 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB25P57735 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB25P57735 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB25P57735 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB25P57735 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB25P57735 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB25P57735 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB25P57735 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB25P57735 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB25P57735 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB25P57735 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB25P57735 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB25P57735 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB25P57735 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB25P57735 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB25P57735 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB25P57735 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB25P57735 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB25P57735 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB25P57735 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB25P57735 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB25P57735 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB25P57735 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB25P57735 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB25P57735 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB25P57735 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB25P57735 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB25P57735 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB25P57735 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB25P57735 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB25P57735 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB25P57735 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB25P57735 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB25P57735 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB25P57735 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB25P57735 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB25P57735 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB25P57735 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms