Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcbp4P57724 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp4P57724 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp4P57724 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp4P57724 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp4P57724 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms