Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP3P57721 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP3P57721 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP3P57721 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms