Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR4P57081 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR4P57081 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR4P57081 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR4P57081 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR4P57081 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR4P57081 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR4P57081 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR4P57081 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR4P57081 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR4P57081 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR4P57081 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR4P57081 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR4P57081 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR4P57081 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR4P57081 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR4P57081 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR4P57081 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR4P57081 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR4P57081 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR4P57081 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR4P57081 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR4P57081 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR4P57081 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR4P57081 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR4P57081 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR4P57081 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR4P57081 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR4P57081 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR4P57081 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR4P57081 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR4P57081 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR4P57081 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR4P57081 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR4P57081 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR4P57081 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR4P57081 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR4P57081 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR4P57081 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR4P57081 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR4P57081 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR4P57081 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR4P57081 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR4P57081 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR4P57081 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR4P57081 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR4P57081 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR4P57081 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR4P57081 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR4P57081 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR4P57081 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR4P57081 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR4P57081 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR4P57081 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR4P57081 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR4P57081 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR4P57081 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR4P57081 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR4P57081 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR4P57081 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR4P57081 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR4P57081 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR4P57081 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR4P57081 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR4P57081 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR4P57081 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR4P57081 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR4P57081 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms