Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rp1P56716 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rp1P56716 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rp1P56716 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1P56716 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rp1P56716 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1P56716 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rp1P56716 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rp1P56716 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1P56716 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1P56716 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1P56716 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rp1P56716 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms