Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp5bP56480 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp5bP56480 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms