Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aqp4P55088 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aqp4P55088 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aqp4P55088 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aqp4P55088 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms