Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acod1P54987 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acod1P54987 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acod1P54987 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acod1P54987 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Acod1P54987 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Acod1P54987 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Acod1P54987 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acod1P54987 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acod1P54987 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acod1P54987 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acod1P54987 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acod1P54987 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 417.4 ms