Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB1P54762 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB1P54762 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EPHB1P54762 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms