Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPHB3P54753 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHB3P54753 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHB3P54753 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHB3P54753 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms