Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CACNB3P54284 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CACNB3P54284 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CACNB3P54284 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CACNB3P54284 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNB3P54284 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1163.9 ms