Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATN1P54259 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATN1P54259 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATN1P54259 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATN1P54259 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATN1P54259 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATN1P54259 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATN1P54259 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATN1P54259 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATN1P54259 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATN1P54259 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATN1P54259 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATN1P54259 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATN1P54259 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATN1P54259 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATN1P54259 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATN1P54259 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATN1P54259 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATN1P54259 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATN1P54259 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATN1P54259 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATN1P54259 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATN1P54259 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATN1P54259 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATN1P54259 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATN1P54259 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATN1P54259 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATN1P54259 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATN1P54259 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATN1P54259 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATN1P54259 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATN1P54259 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATN1P54259 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATN1P54259 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATN1P54259 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATN1P54259 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATN1P54259 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATN1P54259 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATN1P54259 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATN1P54259 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATN1P54259 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATN1P54259 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATN1P54259 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATN1P54259 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATN1P54259 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATN1P54259 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATN1P54259 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATN1P54259 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATN1P54259 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATN1P54259 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATN1P54259 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATN1P54259 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATN1P54259 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATN1P54259 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATN1P54259 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATN1P54259 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATN1P54259 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATN1P54259 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATN1P54259 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATN1P54259 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATN1P54259 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATN1P54259 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATN1P54259 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATN1P54259 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATN1P54259 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATN1P54259 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATN1P54259 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATN1P54259 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATN1P54259 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATN1P54259 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATN1P54259 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms