Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn1P54254 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atxn1P54254 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn1P54254 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms