Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRISP3P54108 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRISP3P54108 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRISP3P54108 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRISP3P54108 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms