Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRISP1P54107 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRISP1P54107 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP1P54107 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRISP1P54107 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms