Protein–RNA interactions for Protein: P53995

Anapc1, Anaphase-promoting complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anapc1P53995 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anapc1P53995 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Anapc1P53995 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Anapc1P53995 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Anapc1P53995 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms