Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 LDB7YBL006C 543 nt8.74□□□□□ -1.01
HEF3P53978 TOK1YJL093C 2076 nt8.74□□□□□ -1.01
HEF3P53978 MPH3YJR160C 1809 nt8.73□□□□□ -1.01
HEF3P53978 YNR005CYNR005C 405 nt8.73□□□□□ -1.01
HEF3P53978 SEC24YIL109C 2781 nt8.73□□□□□ -1.01
HEF3P53978 HTZ1YOL012C 405 nt8.72□□□□□ -1.01
HEF3P53978 YIL177CYIL177C 5277 nt8.72□□□□□ -1.01
HEF3P53978 PRB1YEL060C 1908 nt8.72□□□□□ -1.01
HEF3P53978 ENB1YOL158C 1821 nt8.71□□□□□ -1.01
HEF3P53978 PHO85YPL031C 918 nt8.71□□□□□ -1.02
HEF3P53978 IRC5YFR038W 2562 nt8.69□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YAL045CYAL045C 309 nt8.69□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YOL046CYOL046C 675 nt8.69□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YOL099CYOL099C 492 nt8.69□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YLL058WYLL058W 1728 nt8.68□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YER137CYER137C 447 nt8.68□□□□□ -1.02
HEF3P53978 NTG2YOL043C 1143 nt8.68□□□□□ -1.02
HEF3P53978 LPD1YFL018C 1500 nt8.68□□□□□ -1.02
HEF3P53978 PLB3YOL011W 2061 nt8.68□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YJL163CYJL163C 1668 nt8.67□□□□□ -1.02
HEF3P53978 SUN4YNL066W 1263 nt8.67□□□□□ -1.02
HEF3P53978 APE4YHR113W 1473 nt8.66□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YIP4YGL198W 708 nt8.66□□□□□ -1.02
HEF3P53978 ERG10YPL028W 1197 nt8.66□□□□□ -1.02
HEF3P53978 TOD6YBL054W 1578 nt8.65□□□□□ -1.02
HEF3P53978 LOT6YLR011W 576 nt8.65□□□□□ -1.02
HEF3P53978 YMR253CYMR253C 1245 nt8.65□□□□□ -1.02
HEF3P53978 AGX1YFL030W 1158 nt8.64□□□□□ -1.03
HEF3P53978 REC107YJR021C 945 nt8.63□□□□□ -1.03
HEF3P53978 YPR127WYPR127W 1038 nt8.62□□□□□ -1.03
HEF3P53978 DLD1YDL174C 1764 nt8.61□□□□□ -1.03
HEF3P53978 SNF4YGL115W 969 nt8.61□□□□□ -1.03
HEF3P53978 YPR076WYPR076W 375 nt8.61□□□□□ -1.03
HEF3P53978 CYS4YGR155W 1524 nt8.6□□□□□ -1.03
HEF3P53978 RPL31BYLR406C 342 nt8.6□□□□□ -1.03
HEF3P53978 AAD14YNL331C 1131 nt8.6□□□□□ -1.03
HEF3P53978 CEM1YER061C 1329 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 ERR1YOR393W 1314 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 ERR2YPL281C 1314 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 MSG5YNL053W 1470 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 MET30YIL046W 1923 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 ATP10YLR393W 840 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 YNL190WYNL190W 615 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 FIT2YOR382W 462 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 ICP55YER078C 1536 nt8.59□□□□□ -1.03
HEF3P53978 MSC3YLR219W 2187 nt8.58□□□□□ -1.04
HEF3P53978 YGL102CYGL102C 429 nt8.57□□□□□ -1.04
HEF3P53978 MIX17YMR002W 471 nt8.57□□□□□ -1.04
HEF3P53978 SSC1YJR045C 1965 nt8.57□□□□□ -1.04
HEF3P53978 TDP1YBR223C 1635 nt8.56□□□□□ -1.04
HEF3P53978 NUP84YDL116W 2181 nt8.56□□□□□ -1.04
HEF3P53978 MRPL35YDR322W 1104 nt8.55□□□□□ -1.04
HEF3P53978 CBR1YIL043C 855 nt8.55□□□□□ -1.04
HEF3P53978 NUP49YGL172W 1419 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 PPH21YDL134C 1110 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 RPL2BYIL018W 765 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 SPG5YMR191W 1122 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 YOR012WYOR012W 414 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 YOR111WYOR111W 699 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 SEC62YPL094C 825 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 SMX3YPR182W 261 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 LAS17YOR181W 1902 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 BNA3YJL060W 1335 nt8.54□□□□□ -1.04
HEF3P53978 URH1YDR400W 1023 nt8.53□□□□□ -1.04
HEF3P53978 PRI1YIR008C 1230 nt8.53□□□□□ -1.04
HEF3P53978 FCP1YMR277W 2199 nt8.53□□□□□ -1.04
HEF3P53978 POB3YML069W 1659 nt8.53□□□□□ -1.04
HEF3P53978 FMP40YPL222W 2067 nt8.52□□□□□ -1.05
HEF3P53978 YCR041WYCR041W 333 nt8.52□□□□□ -1.05
HEF3P53978 HOC1YJR075W 1191 nt8.52□□□□□ -1.05
HEF3P53978 YLL056CYLL056C 897 nt8.52□□□□□ -1.05
HEF3P53978 SNT309YPR101W 528 nt8.52□□□□□ -1.05
HEF3P53978 PTC7YHR076W 1032 nt8.51□□□□□ -1.05
HEF3P53978 LIA1YJR070C 978 nt8.51□□□□□ -1.05
HEF3P53978 HEM14YER014W 1620 nt8.51□□□□□ -1.05
HEF3P53978 CRH1YGR189C 1524 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 MHP1YJL042W 4197 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 MRPS28YDR337W 861 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 MRPL28YDR462W 444 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 YLR112WYLR112W 420 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 LSC1YOR142W 990 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 TUF1YOR187W 1314 nt8.5□□□□□ -1.05
HEF3P53978 FCY22YER060W-A 1593 nt8.49□□□□□ -1.05
HEF3P53978 GPD1YDL022W 1176 nt8.49□□□□□ -1.05
HEF3P53978 HED1YDR014W-A 489 nt8.48□□□□□ -1.05
HEF3P53978 YNL092WYNL092W 1203 nt8.48□□□□□ -1.05
HEF3P53978 ASR1YPR093C 867 nt8.48□□□□□ -1.05
HEF3P53978 VBA5YKR105C 1749 nt8.48□□□□□ -1.05
HEF3P53978 COX15YER141W 1461 nt8.47□□□□□ -1.05
HEF3P53978 YKL102CYKL102C 306 nt8.47□□□□□ -1.05
HEF3P53978 AIM2YAL049C 741 nt8.47□□□□□ -1.05
HEF3P53978 RFS1YBR052C 633 nt8.47□□□□□ -1.05
HEF3P53978 DOT1YDR440W 1749 nt8.46□□□□□ -1.05
HEF3P53978 LCL3YGL085W 825 nt8.46□□□□□ -1.06
HEF3P53978 MRPL19YNL185C 477 nt8.46□□□□□ -1.06
HEF3P53978 AMN1YBR158W 1650 nt8.46□□□□□ -1.06
HEF3P53978 ERS1YCR075C 783 nt8.45□□□□□ -1.06
HEF3P53978 AQR1YNL065W 1761 nt8.45□□□□□ -1.06
HEF3P53978 TRS31YDR472W 852 nt8.43□□□□□ -1.06
HEF3P53978 ILV6YCL009C 930 nt8.43□□□□□ -1.06
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