Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACLYP53396 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ACLYP53396 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACLYP53396 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACLYP53396 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACLYP53396 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACLYP53396 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ACLYP53396 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ACLYP53396 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACLYP53396 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACLYP53396 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACLYP53396 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACLYP53396 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACLYP53396 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACLYP53396 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACLYP53396 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACLYP53396 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ACLYP53396 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ACLYP53396 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACLYP53396 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ACLYP53396 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ACLYP53396 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACLYP53396 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ACLYP53396 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACLYP53396 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACLYP53396 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ACLYP53396 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACLYP53396 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACLYP53396 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ACLYP53396 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACLYP53396 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACLYP53396 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACLYP53396 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACLYP53396 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACLYP53396 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACLYP53396 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACLYP53396 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACLYP53396 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACLYP53396 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACLYP53396 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACLYP53396 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACLYP53396 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACLYP53396 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACLYP53396 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACLYP53396 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACLYP53396 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACLYP53396 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACLYP53396 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACLYP53396 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACLYP53396 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACLYP53396 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACLYP53396 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACLYP53396 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACLYP53396 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACLYP53396 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACLYP53396 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACLYP53396 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACLYP53396 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACLYP53396 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACLYP53396 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACLYP53396 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACLYP53396 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACLYP53396 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACLYP53396 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACLYP53396 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACLYP53396 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ACLYP53396 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ACLYP53396 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACLYP53396 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACLYP53396 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ACLYP53396 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACLYP53396 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACLYP53396 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ACLYP53396 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACLYP53396 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACLYP53396 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACLYP53396 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ACLYP53396 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms