Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBX2P52951 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX2P52951 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX2P52951 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX2P52951 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX2P52951 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBX2P52951 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX2P52951 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX2P52951 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX2P52951 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX2P52951 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX2P52951 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBX2P52951 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX2P52951 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX2P52951 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX2P52951 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBX2P52951 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX2P52951 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX2P52951 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBX2P52951 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBX2P52951 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBX2P52951 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX2P52951 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX2P52951 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX2P52951 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBX2P52951 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX2P52951 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX2P52951 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX2P52951 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBX2P52951 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBX2P52951 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX2P52951 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX2P52951 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX2P52951 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX2P52951 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX2P52951 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX2P52951 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX2P52951 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX2P52951 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX2P52951 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX2P52951 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX2P52951 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX2P52951 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX2P52951 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX2P52951 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX2P52951 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX2P52951 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GBX2P52951 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX2P52951 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX2P52951 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX2P52951 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX2P52951 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX2P52951 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX2P52951 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX2P52951 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX2P52951 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX2P52951 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX2P52951 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX2P52951 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX2P52951 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX2P52951 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX2P52951 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX2P52951 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX2P52951 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX2P52951 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX2P52951 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX2P52951 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX2P52951 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX2P52951 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX2P52951 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX2P52951 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX2P52951 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GBX2P52951 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GBX2P52951 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBX2P52951 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX2P52951 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX2P52951 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX2P52951 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX2P52951 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBX2P52951 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms