Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fgd1P52734 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fgd1P52734 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fgd1P52734 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fgd1P52734 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fgd1P52734 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms