Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkmP52480 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PkmP52480 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkmP52480 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PkmP52480 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PkmP52480 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PkmP52480 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PkmP52480 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PkmP52480 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PkmP52480 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkmP52480 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PkmP52480 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkmP52480 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkmP52480 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PkmP52480 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkmP52480 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkmP52480 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkmP52480 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PkmP52480 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkmP52480 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkmP52480 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkmP52480 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkmP52480 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkmP52480 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkmP52480 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkmP52480 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkmP52480 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkmP52480 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkmP52480 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkmP52480 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PkmP52480 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PkmP52480 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PkmP52480 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PkmP52480 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkmP52480 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkmP52480 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkmP52480 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkmP52480 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkmP52480 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PkmP52480 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PkmP52480 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkmP52480 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkmP52480 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkmP52480 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkmP52480 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkmP52480 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkmP52480 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkmP52480 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PkmP52480 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PkmP52480 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PkmP52480 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkmP52480 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkmP52480 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkmP52480 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PkmP52480 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PkmP52480 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PkmP52480 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkmP52480 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkmP52480 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkmP52480 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkmP52480 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkmP52480 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkmP52480 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkmP52480 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkmP52480 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkmP52480 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkmP52480 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkmP52480 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkmP52480 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkmP52480 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkmP52480 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkmP52480 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkmP52480 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PkmP52480 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PkmP52480 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PkmP52480 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PkmP52480 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PkmP52480 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkmP52480 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkmP52480 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkmP52480 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkmP52480 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkmP52480 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkmP52480 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkmP52480 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkmP52480 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PkmP52480 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PkmP52480 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PkmP52480 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PkmP52480 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PkmP52480 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PkmP52480 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PkmP52480 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PkmP52480 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PkmP52480 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PkmP52480 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PkmP52480 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkmP52480 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkmP52480 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkmP52480 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms