Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1cP52432 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr1cP52432 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr1cP52432 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1cP52432 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Polr1cP52432 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1cP52432 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1cP52432 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1cP52432 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1cP52432 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1cP52432 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1cP52432 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1cP52432 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1cP52432 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1cP52432 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1cP52432 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1cP52432 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1cP52432 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1cP52432 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1cP52432 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1cP52432 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1cP52432 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1cP52432 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1cP52432 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1cP52432 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1cP52432 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1cP52432 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1cP52432 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Polr1cP52432 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1cP52432 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1cP52432 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Polr1cP52432 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1cP52432 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms