Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn1P51942 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn1P51942 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matn1P51942 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn1P51942 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Matn1P51942 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matn1P51942 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn1P51942 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn1P51942 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Matn1P51942 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matn1P51942 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matn1P51942 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn1P51942 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn1P51942 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matn1P51942 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn1P51942 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Matn1P51942 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms