Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apobec1P51908 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apobec1P51908 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec1P51908 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec1P51908 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms