Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR3P51677 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR3P51677 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR3P51677 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR3P51677 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR3P51677 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR3P51677 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR3P51677 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCR3P51677 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CCR3P51677 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCR3P51677 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCR3P51677 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCR3P51677 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCR3P51677 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR3P51677 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR3P51677 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR3P51677 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR3P51677 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR3P51677 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCR3P51677 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR3P51677 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR3P51677 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR3P51677 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCR3P51677 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR3P51677 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR3P51677 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR3P51677 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR3P51677 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR3P51677 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCR3P51677 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCR3P51677 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR3P51677 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCR3P51677 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR3P51677 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR3P51677 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR3P51677 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR3P51677 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCR3P51677 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR3P51677 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR3P51677 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR3P51677 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR3P51677 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCR3P51677 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR3P51677 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR3P51677 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR3P51677 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR3P51677 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCR3P51677 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR3P51677 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCR3P51677 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR3P51677 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR3P51677 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR3P51677 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCR3P51677 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCR3P51677 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCR3P51677 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR3P51677 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCR3P51677 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR3P51677 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR3P51677 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR3P51677 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR3P51677 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCR3P51677 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR3P51677 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR3P51677 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR3P51677 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR3P51677 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR3P51677 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR3P51677 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCR3P51677 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR3P51677 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR3P51677 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR3P51677 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCR3P51677 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR3P51677 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR3P51677 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR3P51677 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR3P51677 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCR3P51677 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms