Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRCA2P51587 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRCA2P51587 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BRCA2P51587 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRCA2P51587 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms