Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE6CP51160 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6CP51160 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE6CP51160 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6CP51160 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms