Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBP50607 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBP50607 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBP50607 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBP50607 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBP50607 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBP50607 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBP50607 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBP50607 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBP50607 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBP50607 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBP50607 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBP50607 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBP50607 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBP50607 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBP50607 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBP50607 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBP50607 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBP50607 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBP50607 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBP50607 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBP50607 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBP50607 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBP50607 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBP50607 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBP50607 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBP50607 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBP50607 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBP50607 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBP50607 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBP50607 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBP50607 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBP50607 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBP50607 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBP50607 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBP50607 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBP50607 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBP50607 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBP50607 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBP50607 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBP50607 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBP50607 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBP50607 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBP50607 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBP50607 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBP50607 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBP50607 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBP50607 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBP50607 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBP50607 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBP50607 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBP50607 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBP50607 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBP50607 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBP50607 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBP50607 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBP50607 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBP50607 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBP50607 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBP50607 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBP50607 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBP50607 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBP50607 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBP50607 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBP50607 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBP50607 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBP50607 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBP50607 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBP50607 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBP50607 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBP50607 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBP50607 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBP50607 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBP50607 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBP50607 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBP50607 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBP50607 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBP50607 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478.2 ms