Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdi1P50396 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdi1P50396 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdi1P50396 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdi1P50396 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gdi1P50396 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdi1P50396 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms