Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN1CP49918 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN1CP49918 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKN1CP49918 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKN1CP49918 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKN1CP49918 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms