Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psen1P49769 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psen1P49769 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psen1P49769 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psen1P49769 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psen1P49769 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psen1P49769 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psen1P49769 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psen1P49769 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psen1P49769 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psen1P49769 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psen1P49769 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psen1P49769 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms