Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRIM1P49642 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PRIM1P49642 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRIM1P49642 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRIM1P49642 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms