Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc3P49135 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc3P49135 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ercc3P49135 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc3P49135 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc3P49135 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc3P49135 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms