Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PITPNBP48739 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PITPNBP48739 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITPNBP48739 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITPNBP48739 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms