Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCLCP48506 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCLCP48506 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCLCP48506 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCLCP48506 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCLCP48506 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCLCP48506 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCLCP48506 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCLCP48506 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCLCP48506 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GCLCP48506 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GCLCP48506 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCLCP48506 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GCLCP48506 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCLCP48506 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCLCP48506 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCLCP48506 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCLCP48506 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCLCP48506 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCLCP48506 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCLCP48506 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCLCP48506 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GCLCP48506 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCLCP48506 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCLCP48506 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GCLCP48506 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GCLCP48506 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCLCP48506 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCLCP48506 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCLCP48506 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCLCP48506 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCLCP48506 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCLCP48506 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCLCP48506 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCLCP48506 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCLCP48506 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCLCP48506 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCLCP48506 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCLCP48506 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GCLCP48506 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCLCP48506 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCLCP48506 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCLCP48506 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCLCP48506 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCLCP48506 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCLCP48506 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GCLCP48506 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCLCP48506 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCLCP48506 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCLCP48506 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCLCP48506 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCLCP48506 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCLCP48506 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCLCP48506 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCLCP48506 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCLCP48506 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCLCP48506 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCLCP48506 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCLCP48506 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCLCP48506 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GCLCP48506 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCLCP48506 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCLCP48506 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCLCP48506 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCLCP48506 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GCLCP48506 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCLCP48506 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCLCP48506 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCLCP48506 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCLCP48506 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GCLCP48506 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms