Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARCN1P48444 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARCN1P48444 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCN1P48444 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARCN1P48444 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms