Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpl13P47963 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpl13P47963 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl13P47963 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl13P47963 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms