Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZBP47756 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPZBP47756 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPZBP47756 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZBP47756 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZBP47756 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZBP47756 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPZBP47756 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms