Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nedd4P46935 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nedd4P46935 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nedd4P46935 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nedd4P46935 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nedd4P46935 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nedd4P46935 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms