Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps4bP46467 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps4bP46467 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4bP46467 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps4bP46467 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms