Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TSFMP43897 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSFMP43897 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSFMP43897 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSFMP43897 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSFMP43897 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSFMP43897 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSFMP43897 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSFMP43897 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSFMP43897 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSFMP43897 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSFMP43897 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSFMP43897 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSFMP43897 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSFMP43897 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSFMP43897 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSFMP43897 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSFMP43897 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSFMP43897 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSFMP43897 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSFMP43897 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSFMP43897 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSFMP43897 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSFMP43897 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSFMP43897 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSFMP43897 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSFMP43897 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSFMP43897 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSFMP43897 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSFMP43897 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSFMP43897 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSFMP43897 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSFMP43897 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSFMP43897 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSFMP43897 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSFMP43897 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSFMP43897 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSFMP43897 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSFMP43897 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSFMP43897 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSFMP43897 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSFMP43897 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSFMP43897 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSFMP43897 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSFMP43897 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSFMP43897 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSFMP43897 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSFMP43897 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSFMP43897 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSFMP43897 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSFMP43897 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSFMP43897 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSFMP43897 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSFMP43897 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSFMP43897 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSFMP43897 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSFMP43897 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSFMP43897 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSFMP43897 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSFMP43897 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSFMP43897 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSFMP43897 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSFMP43897 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSFMP43897 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSFMP43897 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSFMP43897 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSFMP43897 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSFMP43897 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSFMP43897 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSFMP43897 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSFMP43897 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSFMP43897 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSFMP43897 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSFMP43897 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSFMP43897 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSFMP43897 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSFMP43897 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms